Григорий Мусатов родился в Бузулуке 28 января 1889 года. Он был сыном бузулукского, а впоследствии самарского иконописца Алексея Яковлевича Мусатова и польки Элеоноры Клеофасовны Миклашевич. С юных лет мальчик помогал отцу в качестве подмастерья в иконостасной мастерской. Детство и юность Григория прошли в Бузулуке и в Самаре. Жизнь этих городов, с такими нехитрыми развлечениями, как оркестры в парках, катания на лодках, прогулки, посещения фотоателье, прочно вошла в сознание будущего мастера. Всё это станет в будущем темами работ художника.
По окончании начального училища Григорий Мусатов был зачислен в Самарское коммерческое училище, где с 1903 до 1913 года преподавал рисование художник, коллекционер, а впоследствии один из основателей Самарского художественного музея Василий Васильевич Гундобин. Увлекшийся под его руководством живописью Григорий Мусатов перевелся в Пензенское художественное училище, которое, правда, вскоре бросил. Затем художник перебрался в Киев, где поступил в художественное училище. Здесь он энтузиазмом занимался под руководством Александра Александровича Мурашко, которого ценил и уважал. При посещении Москвы, где в Московском училище живописи, ваяния и зодчества учился брат Григория Александр, художник соприкоснулся с модернизмом, повлиявшим на его творчество.
В Пензе Григорий Мусатов познакомился с Верой Георгиевной Еляшович (10.04.1893, Пенза – 23.05.1971, Прага), которая, согласно пражским документам, была дочерью производителя чернил Георгия Еляшовича и П. М. Аркинд. С ней в искусство Григория Мусатова вошла еврейская тема. В 1914 году они сочетались гражданским браком, и в этом же году Григорий недолгое время работал учителем рисования в посаде Мелекесс Ставропольского уезда Самарской губернии.
В 1915 году в Самаре прошла художественная выставка, в которой Григорий Мусатов принимал участие совместно с Гундобиным и братом Александром. В том же году был мобилизован и служил штабным писарем в городе Балашов Саратовской губернии. Там, по воспоминаниям его дочери Норы, участвовал в росписи церкви, длившейся примерно год.